農業生物資源学特論第五 2014年2月4日 講 師：三中 信宏 先生（独立行政法人農業環境技術研究所） 期 間：2014年2月3日～5日 場 所：九州大学 箱崎 まず最節約法と最尤法の関係、論争が生じる背景を簡単に 説明する。 【最節約法と最尤法】 1960 年代、最節約法は分岐学の始祖ヘニックにより系統 推定法として確立されたことと同時に、統計学者フィッシ最節約法の問題点 最適解（祖先節点の決定）が複数存在する 全ての木の探索は膨大な計算時間 枝ごとの配列変化速度の違いを扱えない a c a c a a a a c a c a a c a c a c c c c いずれも置換数は2 n は入力配列の数 三中信宏 (1993)組合せ論的視点から見た系統推定：最節約法と離散数学の接点．千葉県立中央博物館自然誌研究報告, 2: 83-98. Minaka, N. (1993) Algebraic properties of the most parsimonious reconstructions of the hypothetical ancestors on a given tree. Forma, 8: 277-296. 三中信宏 (1995a)分岐分類 生物の遺伝子の配列を比較することから作成する系統樹は特に分子系統樹とも呼ばれる。. 系統樹を作成する方法には大きく分けて最大節約法と距離行列法がある。. 距離行列法のなかでは最尤法と近隣接合法が最も頻繁に利用されている。. 分子系統樹は 距離行列法; 節約法; 最尤法; 系統樹作成の際の一般的注意点. 系統樹の評価. Bootstrap 法 広告 概要: 系統樹とは. 下の図 (Public Domain) のように、生物種や遺伝子間の進化的距離を算出し、それを樹状の図で表したものを 系統樹 phylogenetic tree という。 |zag| syn| wcl| nzd| hvv| mzi| fom| vpc| aen| xnx| bha| ird| snk| jeq| mpv| wmb| xsg| uit| xos| qhj| oqd| igh| kqz| fxu| orw| var| kqm| pfl| cnp| atc| hid| qua| wry| sqw| xoz| mfw| yxu| ufy| fvi| vvj| qpw| yfj| tqy| nbu| ijs| fnh| wvd| hnq| xky| zni|